|
Tel Aviv University –
School of Computer Science Workshop - Spring 2021 Workshop on Machine
Learning in Healthcare סדנה בניתוח מידע רפואי בעזרת שיטות מלמידה
חישובית
Instructor:
Prof. Ron Shamir TA:
Dan Coster |
||||
|
הסדנה
תתמקד בניתוח חישובי ובניית מערכות לומדות עבור נתונים רפואיים (Electronic Medical Records) בעזרת כלים מלמידת מכונה וסטטיסטיקה. במסגרת הסדנה ינותחו
בסיסי נתונים של מחלקות טיפול נמרץ המכילים נתוני אשפוז של מאות אלפי חולים.
נושאי הפרויקטים יהיו מגוונים וייקבעו בצוותא עם הסטודנטים. ייעשה מאמץ לקבל
משוב במהלך הסדנה מרופאים ממחלקות טיפול-נמרץ בכדי לוודא את הרלוונטיות הקלינית
של המודלים שיפותחו. הסדנה
תכלול מספר מפגשים התחלתיים בהם יינתן רקע חישובי ורפואי, ולאחר מכן פגישות
אישיות עם צוותי הפרויקטים השונים. בסיכום ייערך מפגש משותף להצגת הפרויקטים. אין
צורך בידע רפואי או ביולוגי קודם. הסדנה
פתוחה לכל תלמידי מדעי המחשב. ברישום הראשון תינתן עדיפות לתלמידי מסלול הביואינפורמטיקה. The
digitization of medical records around the world has reached advanced stage,
which opens many possibilities of using the data to improve medical practice.
Medical data form the basis for the development of precision and personalized
medicine, and enable the development of complex models that will assist in
the clinical decision-making process of the attending physician. The
workshop will focus on computational analysis and building learning systems
for electronic medical records using methodologies from machine learning and
statistics. As part of the workshop, databases of intensive care units (ICUs)
containing hospitalization data of hundreds of thousands of patients will be
analyzed. The topics of the projects will be determined together with the
students, with different groups focusing on distinct projects. Efforts will
be made to receive feedback during the workshop from physicians from ICUs, in
order to ascertain the clinical relevance of the models that are being
developed. The
workshop will include a number of initial sessions in which a computational
and medical background will be provided, followed by in-person sessions with
each project team. A joint summary meeting will be held to present the final
projects. No
prior medical or biological knowledge is required. The
workshop is open to all Computer Science students. In the first registration
round, students in the Bioinformatics track will be given priority. Logistics: The project will be done in groups
of two or at most three students. There will be several introductory meetings
and one final meeting of all participants. All other activities will be by interaction
between individual groups and the instructors, with ad-hoc meetings set as
needed. Schedule: (Wednesdays 17:00-19:00; dates
are tentative) 3/3, 10/3, 17/3: lectures presenting the project and providing
the necessary background Individual
meetings for each group: 1.
07/04/21: Milestone 1 – Initial project plan 2.
05/05/21: Milestone 2 – Progress status - Initial results 3.
16/06/21: Milestone 3 – Progress status update Project
final report and software to be submitted by 22/08/21 Joint final meeting for all students: 4.
26/08/21: Final project presentations. Additional course
information and data will be provided on Moodle. |
