|
הסדנה תעסוק בסיווג (classification) של סוגי סרטן על בסיס ניתוח מידע רחב-היקף
על מוטציות שהתגלו בגנומים של חולי סרטן, במשולב עם
ידע על ההיררכיה בין סוגי הסרטן השונים. הנתונים שאותם ננתח מסכמים מידע שנאסף
מריצוף (חלקי או מלא) של יותר ממיליון גנומים של
חולי סרטן. לסיווג וזיהוי סמנים (biomarkers)
המייחדים כל מחלה נשתמש בשיטות חדישות מלמידה חישובית המותאמות לבעיה בה לכל
דגימה ייתכנו כמה תוויות נכונות (multi
label classification).
הסדנה פתוחה לכל תלמידי מדעי המחשב. תינתן עדיפות בהרשמה לתלמידי מסלול
הביואינפורמטיקה.
Our goal in the workshop is to classify cancer subtypes based on somatic
mutation data. In particular, we would like to determine which mutations
are general to most cancers, and which determine specific subtypes. Having
such information is important for understanding the disease mechanisms and
for predicting the fate of a patient.
The workshop will
have three main phases:
1.
Programming: implementing
predictive clustering trees for multi-label learning.
2. Annotation:
parsing and annotating a selected part of the COSMIC DB
3. Analysis:
learning and interpreting classifiers (both implemented and others).
Logistics:
First meeting: 10 March 12-14. Shenkar
(Physics) room 105.
Second meeting: 19 March 9-11 Kaplun room 324 (note
special time)
All other information will be provided on
Moodle.
|
